Aqui encontramos os os primeiros vestígios de vida na terra há milhões de anos, até à descoberta da sequência do ADN em 1998. Ficamos a conhecer os diferentes meios encontrados pelo homem no combate à doença e podemos visitar uma excelente reconstituição da Farmácia Estácio do Porto, que estava localizada na Rua Sá da Bandeira. É neste museu que se encontra um espólio alargado de objetos de grande valor científico e que são emblemáticos da história da farmácia e da ciência em geral.
Através de uma investigação exaustiva e de uma selecção rigorosa dos testemunhos da história do homem, as temáticas da farmácia e da saúde são abordadas no Museu da Farmácia no Porto com peças de extrema qualidade, oriundas de civilizações e culturas tão distantes no tempo e no espaço como a Mesopotâmia, o Egipto, a Grécia, Roma, os Incas, os Astecas, o Islão, a África, o Tibete, a China, o Japão entre outras.
Para além das visitas guiadas, o Museu da Farmácia dispõe de um programa de ateliers dedicados à educação para a saúde destinados a crianças do ensino pré-escolar ao 3º ciclo.